Il Forte fu costruito tra il 1590 e il 1595 da Bernardo Buontalenti per volontà di Ferdinando I de' Medici allo scopo di proteggere sia Palazzo Pitti, situato nella parte sottostante, sia il lato meridionale della città. Composto da una palazzina centrale e circondato da spaziosi spalti, è collegato ad un sistema di passaggi, appartamenti, corridoi, ponti e giardini (un tempo riservati esclusivamente alla Corte) che consentono di raggiungere il Giardino di Boboli.

È ipotizzabile che qui, come nel caso della Fortezza da Basso, siano state sperimentate le teorie frankliniane sul parafulmine nel momento in cui il Granduca Pietro Leopoldo di Lorena ordinò che tutti i magazzini di polvere da sparo delle principali città del Granducato fossero munite di grosse spranghe di ferro, affidando tale compito a Felice Fontana, uno dei protagonisti in Toscana del dibattito sull'elettricismo.

Attualmente è sede di manifestazioni a carattere culturale.