Fondata nel 1051, fu posta sotto la protezione di Lorenzo de' Medici nel secolo XV e rimase proprietą dei monaci benedettini vallombrosani sino al 1810, quando fu trasformata in villa-fattoria, pur conservando l'originaria funzione di presidio agricolo.

Il giardino ripropone lo schema dell'antico hortus conclusus: le aiuole disposte geometricamente presentano siepi di bosso e piante aromatiche e officinali. Al centro del giardino si trova una vasca in pietra serena di forma rettangolare. I grandi boschi di abeti bianchi, che circondano la badia, sono frutto dell'opera di rimboschimento dei monaci, proseguita anche nel secolo XIX. Accanto alla Badia č possibile ammirare un cedro del Libano dalle dimensioni imponenti (20 metri di altezza e circa 7 metri di diametro della circonferenza del tronco), che rientra nell'elenco delle piante monumentali della Regione Toscana. Nella zona circostante si trovano molte altre piante monumentali di notevole valore botanico.