Il Museo è stato istituito nel 2002 per volontà dell'azienda Aboca, attiva da oltre vent'anni nel settore delle piante medicinali, con lo scopo di delineare un tracciato storico dell'utilizzo delle erbe e di recuperarne l'uso tradizionale. È ubicato nel Palazzo Bourbon del Monte. Nelle sale espositive vengono presentati antichi utensili impiegati nelle spezierie per la conservazione e la preparazione delle erbe medicinali: mortai in bronzo, pietra, alabastro, avorio e legno, di provenienza italiana ed europea; maioliche, ceramiche e vasi in vetro soffiato. Il materiale comprende inoltre attrezzi per la raccolta delle erbe e alcuni strumenti da laboratorio del secolo XVIII. In alcune sale sono stati ricostruiti gli ambienti tradizionali per la lavorazione delle erbe.

La biblioteca possiede libri a stampa databili dal Cinquecento ai primi del Novecento, riguardanti la botanica, la farmacia e la chimica, oltre a raccolte di iconografia botanica e numerosi erbari (con calcografie, xilografie e litografie).