Fondato nel 1961, l'Istituto conserva strumenti e apparati per la didattica della Fisica e delle Scienze Naturali, recentemente recuperati grazie all'attivitą di insegnanti e studenti nell'ambito di varie edizioni dell'annuale Settimana della Cultura Scientifica. Alcuni oggetti sono stati acquistati dopo gli anni Settanta del Novecento, mentre altri provengono dai beni scientifici del vecchio Conservatorio Femminile di San Michele, che aveva sede nei locali che ospitano l'attuale scuola.

Gli strumenti di fisica comprendono vari apparecchi, come una macchina pneumatica, un tubo di Newton, una sfera di Magdeburgo, un modello di macchina a vapore, uno di motore a scoppio e uno di motore diesel. La raccolta naturalistica riunisce preparati zoologici, modelli anatomici, fossili di varia provenienza e campioni di rocce.