Istituito nel 1941, il Liceo scientifico "Antonio Vallisneri" fu in origine ospitato in un'ala del convento di San Ponziano in via Elisa. Nel 1963 venne trasferito nell'attuale sede, realizzata grazie a un finanziamento dell'Amministrazione Provinciale; successivamente, a seguito del progressivo aumento degli iscritti, il complesso è stato ampliato con nuovi spazi, tra i quali il "Padiglione Nuovo", dove sono collocate le collezioni scientifiche del Liceo.

Le collezioni sono costituite da una raccolta naturalistica e da una didattica. Quella naturalistica presenta esemplari di pesci, uccelli, rettili e piccoli mammiferi imbalsamati, montati su supporti in legno o conservati in liquido, risalenti al secolo XX. Comprende inoltre una raccolta malacologica, una di rocce e fossili, una entomologica, un erbario e alcuni modelli didattici botanici, anatomici e orogenetici. La collezione didattica, risalente alla prima metà del Novecento, è composta da strumenti del laboratorio di fisica (strumenti di meccanica, ottica, acustica, calorimetria e apparecchi per lo studio dell'elettromagnetismo e delle radiazioni).