Il Museo, fondato nel 1997, è ospitato, insieme ad un Centro di Documentazione Archeologica, nella settecentesca Villa Baciocchi. Il percorso, essenzialmente didattico, si articola in cinque sale nelle quali sono esposti animali tassidermizzati: invertebrati, mammiferi, uccelli, rettili e pesci provenienti da tutto il mondo. Della collezione fanno parte anche una raccolta di uccelli, acquistata nel 2000, con alcuni esemplari di fine Ottocento e altri reperti, acquistati dal Comune di Capannoli, tra i quali si segnala una raccolta di farfalle.

Il giardino di villa Baciocchi fu ideato, nella seconda metà dell'Ottocento, da Luigi Bellincioni che dotò il parco di edifici neogotici, grotte rustiche e piccole edicole affrescate. Presenta, oggi, 12 alberi monumentali, contrassegnati da didascalie che ne illustrano le caratteristiche. Tra le piante secolari sono da segnalare il bambù, il tasso e la sequoia canadese. Complessivamente il giardino conserva oltre 160 specie di varia provenienza.