Il Dipartimento "Leo Pardi" č stato istituito nel 1985 accorpando gli Istituti di Anatomia Comparata, Biologia Generale e Genetica e di Zoologia, dei quali ha ereditato la lunga tradizione di ricerca, risalente all'Imperial Regio Museo di Fisica e Storia Naturale (fondato nel 1775). Il Dipartimento ha sede nello stesso edificio che accolse l'istituzione lorenese e che ancora oggi ospita il Museo Zoologico "La Specola". Dopo l'annessione della Toscana al Regno Sabaudo, vennero attivati corsi universitari in quello che divenne l'Istituto di Studi Superiori. Con l'istituzione dell'Universitą di Firenze, negli anni Venti del Novecento, l'ente divenne parte dell'ateneo.

Il Dipartimento conserva una collezione di strumenti formata soprattutto da microscopi, da microtomi e da bilance, utilizzati a partire dalla fine dell'Ottocento fino alla metą del Novecento nei laboratori di ricerca. La dotazione sette-ottocentesca č oggi conservata per la maggior parte presso l'Istituto e Museo di Storia della Scienza di Firenze. Fanno parte della collezione anche camere lucide, pesiere, vetrini con preparati e bottiglie.